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              5- 
              L'ADN dans la cellule 
               En 
                février 1953, deux mois avant la publication du célèbre 
                article dans Nature, on raconte que Francis Crick aurait fait 
                irruption dans le pub The 
                Eagle à Cambridge en annonçant qu'il avait, 
                avec James Watson, découvert rien de moins que le 
                secret de la vie.  
              En 
                quoi la structure de l'ADN révèle-t-elle le secret 
                de la vie? En biologie, la fonction 
                est souvent liée à la structure 
                et c'est vrai plus que jamais pour l'ADN. C'est la découverte 
                de la structure de l'ADN qui allait permettre, dans les années 
                suivantes, de comprendre les bases moléculaires de l'hérédité. 
              L'ADN 
                constitue le matériel génétique 
                de la cellule et le matériel génétique 
                d'un être vivant doit : 
              
                - Détenir 
                  l'information génétique propre à son espèce
 
                  Comme nous le verrons, l'ordre d'enchaînement des nucléotides 
                  constitue un message, une information permettant à la 
                  cellule d'assembler dans le bon ordre les acides aminés 
                  de ses protéines. Et c'est la sorte de protéine 
                  que fabrique un être vivant qui détermine ses caractéristiques 
                  physiques.  
                - Pouvoir 
                  se reproduire avec le moins d'erreurs possibles
 
                  À chaque fois qu'une cellule se divise en deux cellules, 
                  l'information doit être reproduite intégralement 
                  de façon à ce que chacune des deux cellules obtenues 
                  détienne l'ensemble de l'information qui était 
                  dans la cellule de départ. 
                - Pouvoir 
                  se modifier (mais pas trop)
 
                  L'ADN n'est pas une molécule d'une stabilité à 
                  toute épreuve. Des modifications accidentelles peuvent 
                  modifier le message. Un nucléotide, par exemple, peut 
                  être remplacé par un autre ce qui modifie le message. 
                  Ce sont ces modifications qui permettent l'évolution. 
                  Sans elles, l'évolution ne serait pas possible. 
                - Pouvoir 
                  être traduit en caractéristiques physiques
 
                  Le message contenu dans l'ADN doit pouvoir être "lu" 
                  par la cellule. Ce n'est pas tout de détenir de l'information, 
                  mais encore, cette information doit pouvoir être utilisée, 
                  elle doit pouvoir être traduite en quelque chose de concret, 
                  en protéines dans le cas de l'ADN. 
               
              Comme vous 
                le verrez plus loin, chacune de ces propriétés fondamentales 
                de la vie découle de la structure de l'ADN. La découverte 
                de la structure de l'ADN a permis de comprendre sous quelle forme 
                est l'information dans la cellule, comment cette information peut 
                se reproduire, comment elle peut se modifier permettant ainsi 
                l'évolution et comment elle peut être traduite en 
                caractéristiques physiques transmissibles à travers 
                les générations. C'était bien le secret de 
                la vie qu'avaient découvert Crick et Watson!  
                
               
              Les cellules 
              procaryotes ne possèdent qu'une seule molécule 
              d'ADN. Cette molécule forme une boucle (les deux extrémités 
              sont liées). Chez la bactérie Escherichia 
              coli, par exemple, presque tout l'ADN de la cellule 
              forme une grande boucle comportant près de 5 millions 
              de paires de bases. La longueur totale de la molécule 
              est d'environ 1,5 mm (près de 500 fois plus long que la bactérie 
              elle-même). Cette énorme molécule contient toute 
              l'information nécessaire à l'assemblage des quelques 
              4000 protéines différentes que peut fabriquer cette 
              bactérie.  | 
             
                 
                   
                
              
                 
                  La 
                      chose peut paraître paradoxale: l'ADN doit être 
                      assez instable pour changer, ce qui permet l'évolution, 
                      mais pas trop. Si l'information se modifie trop vite, la 
                      vie devient impossible puisque, généralement, 
                      les modifications accidentelles de l'ADN sont nuisibles. 
                      Si elle ne se modifie pas du tout, l'évolution devient 
                      impossible car sans changements, il n'y a pas d'évolution. 
                      Nous en reparlerons...  | 
                 
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               Sur 
                la photo ci-contre, on peut voir une Escherichia coli 
                qu'on a fait éclater par un choc osmotique. L'ADN de la 
                bactérie s'est répandu autour. Le fil jaune que 
                vous voyez correspond à une seule molécule d'ADN 
                en forme de boucle. Notez l'échelle: une portion d'ADN 
                d'environ la moitié de la longueur de la cellule correspond 
                à environ 5000 paires de bases. La molécule d'ADN 
                a donc une forme très différente de celle qu'on 
                associe généralement à une molécule. 
                Elle ressemble à un long fil à pêche qu'on 
                aurait déroulé de sa bobine. 
              Dans 
                la cellule eucaryote, presque tout l'ADN est 
                contenu dans le noyau (on en trouve aussi un 
                peu dans les mitochondries et les chloroplastes). 
               | 
           
         
        
           
             
               
                  
                De 
                  plus, chez les eucaryotes, chaque molécule d'ADN du noyau 
                  est enroulée sur des protéines appelées 
                  histones. Chaque 
                  segment d'ADN enroulé sur ses histones forme un  
                  nucléosome. L'ensemble 
                  (ADN et histones) s'enroule à nouveau sur lui-même 
                  pour former une structure plus compacte appelée  
                  chromosome. Un chromosome humain peut 
                  contenir entre 20 et 100 millions de paires de bases. Le nombre 
                  de chromosomes par cellule est caractéristique de l'espèce. 
                  Les cellules humaines, par exemple, contiennent 46 chromosomes 
                  chacune. 
                  
                   
                   
                  L'ensemble formé par l'ADN enroulé sur 8 histones 
                  (illustrées par une petite boule sur le dessin à 
                  droite) forme ce qu'on appelle un nucléosome. 
                  Les histones H1 servent à relier les nucléosomes 
                  les uns aux autres de façon à former une structure 
                  spiralée plus compacte (voir l'illustration à 
                  droite). 
                
                  
                    |   Explorez 
                        la structure du nucléosome 
                       
                        Nucleosome Structure 
                        Appuyez sur les boutons (petits carrés 
                        dans la fenêtre de droite) pour activer les fonctions 
                        script.  
                         
                        Combien y a-t-il de paires de bases (bp) dans le segment 
                        d'ADN enroulé autour des protéines de chaque 
                        nucléosome ? La réponse est dans le 
                        texte de la fenêtre de droite. 
                         
                        Les histones permettent à l'ADN des eucaryotes 
                        de s'enrouler en une structure plus compacte.  
                         
                      Lors 
                        de la mitose, les longs brins d'ADN s'enroulent pour former 
                        des structures assez grosses pour être visibles 
                        au microscope optique : les chromosomes. 
                         
                      Cette 
                        animation 
                        Flash illustre bien comment se fait cet enroulement. 
                        
                       | 
                   
                 
                Dans 
                  le noyau, l'ADN associé à ses protéines 
                  forme une substance visqueuse qu'on a appelée chromatine 
                  à la fin du XIXe siècle (on ne savait pas alors 
                  ce que c'était). Le terme vient du mot grec khrôma 
                  signifiant couleur (la chromatine du noyau a une grande affinité 
                  avec plusieurs des colorants utilisés en microscopie 
                  pour mettre en évidence les structures cellulaires). 
                   
                   
                 
               | 
            
                  
                  
                   
                  L'ADN s'enroule sur des protéines appelées  
                  histones (illustrées, ici, par 
                  les petites boules). L'espèce de gros boudin spiralé 
                  que vous pouvez voir se forme par l'union des nucléosomes 
                  les uns aux autres. Si vous avez de la difficulté à 
                  comprendre ce mode de repliement, faites une recherche sur Google 
                  Images avec le terme "nucleosome". Vous trouverez 
                  de nombreuses autres illustrations.  
                 
                  
                 
                  | 
           
         
        
          
            |  
                 
                On peut voir, surtout sur la photo de droite, la double hélice 
                de Crick et Watson. Elle apparaît comme un mince fil. La 
                photo de gauche est agrandie 50 000 fois et celle de droite 
                150 000 fois.
  | 
             
               L'image 
                ci-contre montre une partie d'un chromosome humain qui a été 
                soumis à un traitement aux enzymes qui a digéré 
                les histones associés à l'ADN. Le ruban d'ADN s'est 
                alors déroulé autour du squelette de protéines. 
                 
                L'image de droite est un agrandissement du rectangle rouge de 
                l'image de gauche. Les structures noires plus foncées au 
                centre de l'image de gauche correspondent à ce qui reste 
                des histones après l'action des enzymes.  | 
           
         
        
          
             
               
              Toute l'information 
                nécessaire pour fabriquer un humain est 
                contenue dans 23 chromosomes. Mis bout à 
                bout, ces 23 chromosomes formeraient un fil de plus d'un mètre 
                de long. Ces 23 molécules d'ADN sont formées d'environ 
                3 milliards de paires de bases. L'ensemble de 
                ces informations forme ce qu'on appelle le génome 
                humain.  
              
                 
                  | Petit 
                    calcul ... | 
                 
                 
                  |  
                     Prenez 
                      un livre que vous avez près de vous (n'importe quel, 
                      ça n'a pas d'importance). Si on représentait 
                      chacune des paires de base de l'ADN par une seule lettre 
                      (A, T, C ou G; comme si on écrivait un seul brin 
                      de la molécule d'ADN), combien faudrait-il de pages 
                      du livre que vous avez choisi pour écrire tout le 
                      génome humain (les 3 milliards de paires de bases 
                      des 23 chromosomes) ? 
                     
                    Si 
                      on représentait chaque nucléotide par un octet 
                      (8 bits), est-ce qu'on pourrait écrire tout le génome 
                      humain sur le disque dur de votre portable? 
                    On 
                      peut coder plus d'un nucléotide dans un octet. Combien 
                      faut-il, au minimum, de bits pour coder un nucléotide? 
                      Si on place plus d'un nucléotide par octet, quel 
                      support pourrait contenir tout le génome humain, 
                      une disquette, un CD, un DVD, plusieurs DVD?  | 
                 
               
              Chez 
                la plupart des pluricellulaires, le noyau de chacune des cellules 
                contient deux exemplaires de chaque chromosome 
                (un hérité du père et un hérité 
                de la mère).  
               
                 | 
            
                 
                  |  
                     Chez 
                      les humains, chaque cellule possède 46 chromosomes, 
                      c'est à dire deux exemplaires de chacun des 
                      23 chromosomes différents caractéristiques 
                      de l'espèce humaine. Pour chaque paire de chromosomes, 
                      un vient du père (il a été apporté 
                      par un spermatozoïde) et l'autre vient de la mère 
                      (il était dans l'ovule).   | 
                 
                | 
           
         
        
        
          
        © 
          Gilles Bourbonnais / Cégep de Sainte Foy   |